האווירה במעבר אלנבי, הסמוך לגבול עם ירדן, הפכה הצהריים לסיוט לאחר שמחבל ירדני, נהג במשאית סיוע המיועדת לעזה, פתח באש מאקדחו במעבר וכאשר נתקל במעצור, דקר למוות 2 ישראלים. המחבל נוטרל על ידי מאבטח במעבר.
כוחות הביטחון פעלו במהירות והצליחו לנטרל את המחבל, במבצע מהיר ומדויק שמנע המשך פגיעה בנוסעים או עובדי המעבר. לפי החשד הראשוני, המחבל המרכזי הוא אזרח ירדני, אשר ירד ממשאית סיוע הומניטרי שהייתה בדרכה לעזה ופתח באש לעבר הקורבנות. חקירה ראשונית בוחנת גם את החשד כי אזרח ירדני נוסף סייע לו בביצוע הפיגוע. בוואלה טענו תחילה כי מדובר ב-3 מחבלים ירדנים. לאחר חקירת שב״כ הסתבר כי הנהג המחבל הושכר על ידי צבא ירדן להובלת הסיוע ההומינטרי.
בעקבות האירוע, המעבר נסגר באופן מיידי למעבר רכבים והולכי רגל. כוחות הביטחון במקום מבצעים סריקות מקיפות ופעולות מניעה כדי למנוע פגיעה נוספת. כמו כן, מתקיים תיאום עם רשויות ירדן לצורך בירור נסיבות האירוע, אך מממשלת ירדן נמסר כי הצד הירדני נשאר פתוח וכי הם עוקבים אחר הדיווחים על הפיגוע הקטלני. רק לאחר שבישראל סגרו את המעבר, ניאות מנהל הביטחון הכללי של ירדן לסגור את המעבר לנוסעים ולמטענים גם מהצד הירדני.
לפי דוברות מגן דוד אדום, ההרוגים הם אזרחים ישראלים בגילאי 60 ו-20. מדובר צה"ל נמסר כי ״בהמשך לדיווח הראשוני על ירי במעבר אלנבי, מחבל הגיע במשאית סיוע הומניטרי מירדן ופתח בירי. כוחות הביטחון ניטרלו את המחבל בנקודה. כוחות צה"ל מחטיבת הבקעה והעמקים מבצעים כעת סריקות ומכתרים את יריחו.״ מדוברות הצלה יו"ש ללא גבולות מסרו כי ישנם ״2 נרצחים הי"ד בפיגוע ירי במעבר אלנבי. סמוך לשעה 14:37 התקבל דיווח על פיגוע ירי במתחם בתוך מעבר אלנבי. רפי סעיד מיחידת האופנועים ועמית וייס כונני הצלה ללא גבולות מד"א שהגיעו במהירות למקום הבחינו ב-2 גברים שוכבים מחוסרי הכרה עם פציעות חודרות מדקירה וירי, יחד עם כוח רפואה של צה"ל הצוותים ביצעו פעולות מצילות חיים אך לצערנו בעקבות אופי הפציעה נקבע מותם בזירה. המחבל חוסל בזירה.״
הפיגוע, כצפוי גרר ביקורת קשה מימין על המשך הכנסת הסיוע ההומניטרי ומדגיש שוב את המתח הביטחוני באזור הגבול עם ירדן, ואת הצורך בפיקוח קפדני על משאיות סיוע והתחבורה בכלל במעבר בין המדינות, בייחוד במציאות הביטחונית המורכבת שאנו חיים.
